求助:如何根据某一具体基因预测调控miRNA
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发布时间：2023-01-26 00:56
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时间：2023-07-12 12:30
miRNA基因和编码基因启动子区核小体定位分析
研究了把基因启动子区的核小体定位对于分析基因的转录*具有重要意义. 利用核小体定位的预测技术——弯曲度谱, 分析了编码基因和miRNA基因启动子周围核小体定位的特征. 基因的转录起始位点处, 有一个核小体缺失区域, 且在下游约200 bp处, 有较强的核小体定位信号. 独立转录的内含子miRNA基因与基因间区miRNA基因, 在启动子区具有相似的核小体定位特征, 在上游0 ~ −400 bp间, 有一个较宽的核小体缺失区域, 在该区域分布有较多的转录因子结合位点; 而依赖编码基因转录的内含子miRNA基因, 其启动子与蛋白编码基因启动子具有相似的核小体定位特征, 在转录起始位点上游−200 ~ −400 bp和−400 ~ −600 bp处, 各有一个较强的核小体定位. 这些结果表明, 独立转录的miRNA基因(包括基因间区miRNA和独立转录内含子miRNA)和蛋白编码基因, 在启动子区可能具有不同的核小体定位特征. 核小体定位不仅参与编码基因的转录调节, 也影响miRNA基因的转录.
