染色体位置如何注释到基因名
发布网友
发布时间:2023-05-06 04:47
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热心网友
时间:2023-11-18 15:48
python
gff3文件: https://www.gencodegenes.org/human/release_19.html
python包:
样式1
输出样式2
提取gff3文件中所需要的信息
提取基因名,基因类型,基因状态,基因水平(1verified loci,2manually annotated loci,3automatically annotated loci)
查看基因类型分布
提取所有已知的蛋白编码基因
压缩
定义重叠位置计算函数
定义输入与输入文件目录
计算重叠基因及重叠部位占染色体位置的百分比
输出样式1
转为一个基因一行的格式
热心网友
时间:2023-11-18 15:48
python
gff3文件: https://www.gencodegenes.org/human/release_19.html
python包:
样式1
输出样式2
提取gff3文件中所需要的信息
提取基因名,基因类型,基因状态,基因水平(1verified loci,2manually annotated loci,3automatically annotated loci)
查看基因类型分布
提取所有已知的蛋白编码基因
压缩
定义重叠位置计算函数
定义输入与输入文件目录
计算重叠基因及重叠部位占染色体位置的百分比
输出样式1
转为一个基因一行的格式