RNASeq分析系列--使用STAR软件进行比对
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发布时间：2023-05-04 10:06
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时间：2023-10-28 00:35
STAR 软件由于其敏感的比对特性，因此在转录组 SNP Calling 过程中使用较多。
对于 Ubuntu 系统：
对于Red Hat, CentOS, Fedora 系统：
一般使用 2-pass 模式进行比对，获得更准确的剪切信息。步骤如下：
生成的 SJ.out.tab 文件为 Tab 分隔符，每一列意义如下：
第二步完成后的 bam 文件仍然无法直接用于 GATK 的变异检测，还需要增加一些操作步骤，请参考 GTAK Call SNP/Indel 流程。
