微生信的基因数

发布网友发布时间：2022-07-30 15:57

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热心网友时间：2024-10-21 16:15

具体基因数需要进行相关的研究。研究系统地比较了来自四项已发表研究对菌群观察结果进行聚类的方法; 尽管没有一种方法始终优于其他方法，但作者确定了某些方法可能表现不佳的关键场景; Bray Curtis （BC）指标在高丰度 OTUs 相对稀少的数据集中导致聚类效果不佳，未加权的 UniFrac （UU）指标在低丰度 OTUs 普遍存在的数据集上聚类效果不佳; 作者合理地结合了 BC 和 UU 来生成一个新的指标，其在所有数据集上都显示出高的性能。
信号肽（SPs）控制着所有生物体的蛋白质分泌和易位，可从序列数据中推测其类型; 研究者编译了一个含5种信号肽的蛋白序列数据集，并根据SP类型定义了区域标记规则，同时采用三重嵌套交叉验证来训练和评估模型; 基于蛋白质语言模型（LMs），作者升级了SignalP，与5.0版本（只能推测3种，Sec/SPIII和Tat/SPII无法预测）相比可以预测全部 5 种信号肽类型; 6.0新版本可适用于宏基因组数据，能够准确预测未知起源和进化遥远的蛋白质序列。