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怎样 预测 circrna 与mircorna cerna

发布网友 发布时间:2022-04-22 06:06

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热心网友 时间:2023-07-12 06:32

环状RNA:动物体内的环状RNA(Circular RNA,CircRNA)是一类具有特殊未知功能的RNA,而且是客观大量存在的。环状RNA由前体RNA通过剪切,然后由线性RNA的头对尾连接形成,以前的研究由于技术水平的*,把这部分客观存在的RNA忽略了,随着深度RNA测序及规模化生物信息技术的发展,研究者才真正发现在生物体内大量存在环状的RNA分子,环状RNA由于形成闭合的环状,在生物体内非常的稳定。重要作用及研究意义:在对circRNA 结构和功能研究的基础上,有研究人员发现它们在动脉粥样硬化,神经系统紊乱,糖尿病和肿瘤等疾病发生过程中,发挥非常重要的作用。对环状RNA研究具有重要的意义:1)circRNA独具的竞争性内源(ceRNA)特征可为药物开发提供新的思路;2)circRNA的组织特异性和稳定性有可能使circRNA成为一种良好的生物标志物;3) circRNA 的研究为生命的进化研究提供新的方向。功能特征:对于环状RNA的具体功能尚未有明确研究报道,目前只有几种假定的说法:1)circRNA可以作为“sponge”海绵吸miRNA ,抑制其功能; 2) circRNA通过碱基互补配对直接*其他RNA水平; 3)circRNA能与蛋白质结合, 抑制蛋白质活性、募集蛋白质复合体的组分或*蛋白质的活性;4)circRNA也可作为翻译的模板指导蛋白质的合成。研究策略:一、环状RNA确定与筛选1)环状RNA生物信息学预测2) 环状RNA高通量测序3)环状RNA表达丰度检测4)FISH 检测环状RNA的亚细胞定位5)NorthernBlot 检测环化RNA的存在二、环状RNA的功能研究1)环状RNA的过表达实验(Gain of function)2)环状RNA功能缺失实验(Loss of function )三、环状RNA的表达*1)环状RNA与miRNA互作结合生物预测及实验验证2)环状RNA与miRNA相互作用预测研究 3)环状RNA与蛋白相互作用研究
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