牙鲆Dh家系怎么得到的
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发布时间：2022-05-30 05:32
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时间：2023-10-10 18:03
在育种研究中，利用分子标记对重要生长性状进行辅助选择，能够提高育种效率。
本研究以生长性状优良的野生牙鲆为母本，采用真鲷精子激活卵子，以静水压抑制卵裂，诱导有丝*雌核发育，获得165个双单倍体；
利用574对SSR引物，首次构建了基于双单倍体的牙鲆遗传连锁图谱，并进行了生长相关性状（体尺相关性状和骨骼相关性状）的QTL定位，并分析克隆系和杂合克隆系的遗传特征，旨在为利用分子标记辅助选育牙鲆优良品种奠定基础。主要研究结果如下
（1）对公共数据中的15268条牙鲆EST序列进行处理和分析。在917条EST序列中查找到SSR，出现频率为12.6%，分布密度为1/5.7kb。优势重复基序为二核苷酸和三核苷酸重复，占63.5%和24.3%，并且分别以(AC)n重复（63.9%）和AGC重复(15%)最多。基序重复次数以6次为最多，占24.0%。运用所得到的EST-SSR序列设计484对引物，经牙鲆群体验证，共获得了357对有效引物，占总引物数73.8%。此研究结果可为后续遗传连锁图谱的构建提供有效的分子标记
（2）对查获和开发的分子标记进行连锁分析，构建了牙鲆遗传连锁图谱。图谱共包含574个分子标记，其中SSR标记446个，EST-SSR标记128个，分布于24个连锁群，平均每个连锁群上有24个标记。图谱总长度为1214.7cM，标记间的平均间隔为2.2cM。图谱实际长度为1248.6cM，预期长度为1320.3cM，图谱的覆盖率为94%。
连锁群长度介于1.2cM和94.3cM之间，其中10号连锁群最长，为94.3cM，2号连锁群最短，只覆盖1.2cM。各连锁群平均图距集中在0.88cM~8.72cM之间。连锁群上平均标记数为23.9个，1号连锁群包含标记数最多，为45个，2号连锁群标记数最少，仅包含2个标记。
该图谱为首个基于双单倍体牙鲆构建的连锁图谱，作图效率更高，利于连续性的资料积累与图谱整合。
