nature 上的细胞图 怎么画

而第三类方法，可以直接完成空间上的配体受体相互作用分析 ，例如Fawkner Corbett 等 在2021年提出的方法，可以使用barcoding空间转录组和单细胞数据，算出相邻的以及单个方格内部，一对指定细胞间，是否存在相互通讯的P值和相关系数；Giotto则是根据HPRI或barcoding数据，得出每对不同类型的细胞间相互通讯的分...

外泌体中的miRNA在病变细胞中的应用：miRNA是一类内源性具有调控功能的非编码RNA，可以与靶mRNA的3’非翻译区结合，从而导致靶基因不同程度的差异性表达。当miRNA运送到远端细胞时外泌体可以保持miRNA的完成性。此外，外泌体中miRNA的分泌常用于...

巴黎大学Marc Lecuit研究团队通过创建独特的感染模型揭示了细节：InlB蛋白通过抑制Fas凋亡信号，减少CD8+ T细胞介导的单核细胞死亡，使得李斯特菌得以通过外周单核细胞的细胞间扩散，悄无声息地进入大脑深处（图1：细胞间扩散路径揭示了细菌的神经入侵策略）。研究人员利用人源化KIE16P小鼠，这些小鼠携带有Eca...

玉米穗分生组织的纵切面和横切面也分别展示在下图的G和H中,其也显示了与scRNA的细胞聚类情况一致。 下图A绘制每个聚类中top2的marker基因的表达情况,其中颜色表示表达量的Z_score值,圆点大小表示细胞表达的百分数。进一步作者对关键的marker基因进行mRNA的原位杂交,颜色深浅表示基因的表达量情况。Marker基因的在组织中的...

清华大学蓝勋团队与生命学院孟安明团队合作，于《Nature Cell Biology》上发布了一项突破性研究，他们绘制了斑马鱼胚胎发育过程中的染色质可及性图谱——ZEPA。这个图谱详尽地展示了604种细胞状态的发育路径，揭示了约96万个CREs在不同细胞状态下基因组的动态可访问区域，为理解细胞身份和功能的基因组动态提供...

检查每种细胞发出的信号 ⚠️注：层次图、网络图、和弦图、热图只是不同的展示方法，展示的内容和代表的意思一模一样 比如在前面的功能富集分析或case control的比较中找到了一些信号通路差异，就可以进一步在细胞水平上验证。层次图（Hierarchy plot）网络图（Circle plot）和弦图（Chord d...

1、基因筛选：Monocle可选取感兴趣的基因（差异基因），并利用这些基因来构造数据。2、降低维度：选择用于细胞排序的基因，对数据进行降维处理。3、pseudotime对细胞排序：通过将表达数据投影到较低维空间，构建细胞间的分化轨迹。结果如下图，各个点代表一个细胞，具有相似状态的细胞被聚在一起。每个分支点...

中国科研团队在单细胞测序领域取得新突破，由王晓群、汤富酬、乔杰和张军等多位知名科学家合作，首次绘制出详尽的人脑前额叶胚胎发育过程的单细胞转录组图谱。这项研究通过解析了人类胚胎大脑前额叶的细胞类型多样性和发育关联，揭示了神经元分化和成熟的关键分子调控机制，为进一步理解大脑高级认知功能和复杂...

近期，美国贝斯以色列女执事医疗中心的研究团队在Nature杂志上发表文章《A single cell atlas of human and mouse white adipose tissue》，通过揭示人类与小鼠的白色脂肪组织单细胞图谱，发现了新的脂肪细胞亚群，并揭示了特定细胞类型与代谢性疾病风险增加的关联。研究首先回顾了白色脂肪组织的重要性及其在...

细胞“胞葬”新视角：代谢调控与稳态维护的秘密 细胞凋亡后的归宿，如同落叶归根，被吞噬细胞以一种独特的方式处理，即“胞葬”（Efferocytosis）。这一过程在维持机体稳态中起着至关重要的作用，一旦出现异常，便可能引发一系列疾病。Morioka等科学家在2018年《Nature》杂志上揭示了这一现象背后的生物化学...

它将哺乳动物滑翔的历史向前推进了至少7000万年，并进一步证实了中生代哺乳动物在形态上的分化，分类和生活习惯远远超出了我们之前的理解。由于更准确的同位素“年龄”最终确定，北京周口店出土的北京猿人头骨于2009年3月12日登上了《自然》杂志的封面。