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转录组测序数据可以用bioconductor分析吗
发布网友
发布时间:2022-04-22 10:23
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热心网友
时间:2023-10-10 15:08
根据你的测序需要,如果是仅仅检测表达,可以使用单端的短序列测序,一般10M以上reads都满足要求,如果是还要检测SNP或可变剪切以及新基因之类的话需要使用更长片段的双端测序,一般2x100以上或者2x125,数据量大概在2-3G以上,当然越多越好。
还要同等预算下建议增加重复数,比增加数据量更加有效也更有意义
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