微生物基因组测序的技术指标是什么

发布网友发布时间：2022-09-19 12:33

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热心网友时间：2023-10-27 22:21

微生物基因组测序按测序精度大致可以分为框架图、精细图和完成图三类。框架图要求基因组覆盖度大于95%，基因区覆盖度达到98%以上，单碱基错误率低于十万分之一；精细图要求基因组覆盖度大于98%，基因区覆盖度达到99%以上，单碱基错误率低于十万分之一，gap数不超过100个；完成图要求完整基因组序列，单碱基错误率低于十万分之一，gap数不超过5个。

参考资料：http://www.personalbio.cn/project_dis.asp?glclassid=63

热心网友时间：2023-10-27 22:22

类型
策略
指标
周期
框架图
Roche 454 FLX+
基因组覆盖度大于95%，基因区覆盖度达到98%以上，单碱基错误率低于十万分之一
30个工作日
精细图
Roche 454 FLX+
IlluminaMiSeq/HiSeq
基因组覆盖度大于98%，基因区覆盖度达到99%以上，单碱基错误率低于十万分之一，gap数不超过100个
50-60个工作日
完成图
Roche 454 FLX+
IlluminaMiSeq/HiSeq
ABI 3730XL
完整基因组序列，单碱基错误率低于十万分之一，gap数不超过5个
3个月