国家水稻数据库里面基因结构怎么看

发布网友发布时间：2022-08-15 22:21

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热心网友时间：2023-09-22 18:14

可以选择红色方框里的数据库，主要用前面两个：genomic sequence 和 CDS sequence。
1、分别是基因组序列和CDS（mRNA）序列。这里选择基因组序列数据库
2、在红色方框里粘贴FASTA格式的序列
3、点击“submit”提交
4、点击blast result 中的 accession下的 LOC号，即红色方框的内
5、在以下页面中，即可下载序列（分别有CDS序列和genomic序列），还可以在 genome browser中查看该基因在基因组中染色体的位置等信息，还有基因结构的信息。该图中浅色部分是UTR，深色部分是CDS
6、用genome browser中查看该基因信息，点选track下的general中的DNA/GC content ，--->update image ，再放大图像即可看到以下结果。