转录组测序中会有one read pair , two read pairs . read pair 是什么东西啊?
发布网友
发布时间:2022-04-28 10:55
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热心网友
时间:2023-09-30 10:03
看你的问题,估计是用illumina的高通量测序,进行RNA-seq的研究吧。
这个问题其实比较简单:
现在的高通量测序,一般分为单端测序(single-end
read)和双端测序(paired-end
reads)。
单端测序只测模板DNA的一端,一般有36SE、50SE两种。
而双端测序需要讲模板的两端(3‘
和
5’)都测序,一般有90PE,100PE两种,你提的问题应该是指:read-pair
one
和
read-pair
tow,是一个模板的两端序列。
注意,paired-end
reads中间的是插入片段,并没有进行测序,但是插入片段长度是有意义的。
热心网友
时间:2023-09-30 10:03
看你的问题,估计是用illumina的高通量测序,进行RNA-seq的研究吧。
这个问题其实比较简单:
现在的高通量测序,一般分为单端测序(single-end
read)和双端测序(paired-end
reads)。
单端测序只测模板DNA的一端,一般有36SE、50SE两种。
而双端测序需要讲模板的两端(3‘
和
5’)都测序,一般有90PE,100PE两种,你提的问题应该是指:read-pair
one
和
read-pair
tow,是一个模板的两端序列。
注意,paired-end
reads中间的是插入片段,并没有进行测序,但是插入片段长度是有意义的。