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目前用于测序的技术主要有哪些?

发布网友 发布时间:2022-05-15 02:36

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热心网友 时间:2023-10-03 05:10

DNA的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前用于测序的技术主要有Sanger等(1977)发明的双脱氧链末端终止法与Gilbert(1977)发明的化学降解法。这两种方法在原理上差异很大,但都是根据核苷酸在某一固定的点开始,随机在某一个特定的碱基处终止,产生A,T,C,G四组不同长度的一系列核苷酸,然后在尿素变性的PAGE胶上电泳进行检测,从而获得DNA序列。目前Sanger测序法得到了广泛的应用。

热心网友 时间:2023-10-03 05:10

目前常用的测序技术有一代Sanger测序,二代常规的illumina测序,擎科生物推出的快速二代测序技术Fast NGS。三代的Pacbio和Nanopore测序。
一代测序技术应用
1. PCR产物测序
对目的基因的PCR产物进行测序,获取目的基因序列;
2. 重测序
如克隆产物验证、SNPs、突变、插入、缺失等;
3. 分型分析菌分类学鉴定、HLA分型、病毒分型等;
4.临床应用
肿瘤突变基因的检测和肿瘤个体化治疗,致病基因位点明确并且数量有限的单基因遗传病检测;
5.对新一代测序技术的结果进行验证。

常规二代测序技术应用
1.基因组de novo测序、转录组测序、重测序、扩增子测序、宏基因组测序、染色质免疫共沉淀测序、DNA甲基化测序等。
2.在医学上的应用主要包括癌症基因组、遗传病基因组、肿瘤与代谢疾病等。

Fast NGS应用:
1.抗体可变区测序;
2.TA克隆测序;
3.菌种鉴定;
4.质粒、病毒、线粒体、叶绿体等小基因组测序;
5.基因编辑上可用于sgRNA文库测序、靶基因鉴定、个体基因型检测、基因编辑效率检测。
比常规二代测序更快速,更优惠,对样本要求更低。

三代测序技术的应用:
1.基因组组装;
2.全长转录组测序;
3.甲基化测序等。
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