区别包括：理论不同，方法不同，应用不同。
1、有机化学主要研究碳化合物及其衍生物，即含有碳元素的化合物，包括烷烃、烯烃、炔烃、醇、醛、酮、羧酸、酯等。有机化学主要关注这些化合物的结构、性质、反应以及之间的相互转化。有机化学的理论基础主要包括分子轨道理论、电负性概念、亲核和亲电反应等。无机化学主要研究不含碳元素的化合物，如氢、氧、氮、磷、硫等。无机化学关注这些元素的单质和化合物，以及性质、结构和反应。无机化学的理论基础主要包括原子轨道理论、分子轨道理论、配位理论等。
2、有机化学的研究方法主要包括合成、分离和鉴定。合成是指通过一系列化学反应，将简单的有机化合物合成复杂的有机分子。分离是指将复杂的混合物分离成单一的化合物。鉴定是指利用各种谱学技术对化合物的结构进行确定。无机化学的研究方法主要包括制备、提纯和鉴定。制备是指通过各种方法合成新的无机化合物。提纯是指将合成得到的化合物进行分离和纯化，得到高纯度的样品。鉴定是指利用各种物理和化学方法确定化合物的结构和性质。
3、有机化学的应用非常广泛，包括医药、农药、涂料、塑料、橡胶、石油、天然气等领域。如通过有机合成方法制备药物，可以开发出治疗疾病的有效药物。无机化学在材料科学、能源科学、环境科学等领域有广泛的应用。例如，通过研究无机化合物的性质和反应，可以开发出高性能的陶瓷材料和金属材料。同时，无机化学在能源领域的研究也有着重要的应用，如太阳能电池和燃料电池等。
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