编制目的不同，编制内容不同，侧重点不同，出发点不同。
1、编制目的不同：施工组织设计是一个工程的战略部署，是对工程全局全方面的纲领性文件。要求具有科学性和指导性，突出“组织”二字;施工方案是依据施工组织设计关于某一分部、分项工程的施工方法面编制的具体的施工工艺，它将对此分部、分项工程的材料、机具、人员、工艺进行详细的部署，保证质量要求和安全文明施工要求，它应具有可行性、针对性，符合施工规范、标准。
2、编制内容不同：施工组织设计编制的对象是工程整体，可以是一个建设项目或-一个单位工程。它所包含的文件内容广泛，涉及工程施工的各个方面。施工方案编制的对象通常指的是分部、分项工程。它是指导具体的一个分部、分项工程施工的实施过程。
3、侧重点不同：施工组织设计侧重于决策，强调全局规划;施工方案侧重于实施，实施讲究可操作性，强调通俗易懂，便于局部具体的施工指导。
4、出发点不同：施工组织设计从项目决策层的角度出发，是决策者意志的文件化反映。它更多反映的是方案确定的原则和如何通过多方案对比确定施工方法。施工方案从项目管理层的角度出发，是对施工方法的细化，它反映的是如何实施、如何保证质量、如何控制安全。
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