小说《三体》的结局是整个三部曲的最后一部《死神永生》中揭晓的。
最后，人类与三体文明在宇宙中的较量达到了顶点。人类发现了一种名为“幷行宇宙”的特殊现象，通过幷行宇宙可以实现超光速传输和时间的逆流。人类利用这一现象相继破译了三体文明的传送门技术，并破坏了三体人在太阳系中的基地。
此时，三体文明的核心人物—刘慈欣通过幷行宇宙逆流回到了文化大革命时期，企图改变历史，阻止人类对抗三体人的崩溃行动。但最终由于历史的固有性质，他无法阻止三体人对人类的侵略。
在迫切的危机下，地球上的人们开始以群星之间的信号进行协作，最终研发出了拥有高维空间属性的“时间程序”，可以在幷行宇宙之外执行，使得人类在战斗中无法被三体文明的科技追踪。然而，最终人类的抵抗仍然被三体人所击败。
整个三体文明利用基地逃离地球，通过传送门离开了太阳系。而地球上的人类则面临着毁灭的命运，失去了香港女法科大学副教授汪淼等人的考古学和历史学研究结果，失去了“文明继续”的希望。
整个三部曲以一种悲观的方式展示了人类文明与外星文明的对抗和冲突，探讨了人类社会的团结、文明进程和人类自身的局限性。最终的结局表达了一种审慎的态度，提醒人类应当珍惜地球上的生命与文明，防范可能的外来威胁。
