刑事案件中应当查明的事实包括：犯罪嫌疑人的身份；犯罪行为是否存在；犯罪行为是否为犯罪嫌疑人实施；犯罪嫌疑人实施犯罪行为的动机、目的；实施犯罪行为的时间、地点、手段、后果以及其他情节；犯罪嫌疑人的责任以及与其他同案人的关系；犯罪嫌疑人有无法定从重、从轻、减轻处罚、免除处罚的情节；其他与案件有关的事实。
《最高人民法院关于适用<中华人民共和国刑事诉讼法>的解释》第七十二条 应当运用证据证明的案件事实包括： （一）被告人、被害人的身份； （二）被指控的犯罪是否存在； （三）被指控的犯罪是否为被告人所实施； （四）被告人有无刑事责任能力，有无罪过，实施犯罪的动机、目的； （五）实施犯罪的时间、地点、手段、后果以及案件起因等； （六）是否系共同犯罪或者犯罪事实存在关联，以及被告人在犯罪中的地位、作用； （七）被告人有无从重、从轻、减轻、免除处罚情节； （八）有关涉案财物处理的事实； （九）有关附带民事诉讼的事实； （十）有关管辖、回避、延期审理等的程序事实； （十一）与定罪量刑有关的其他事实。
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