法律分析：员工发现公司犯罪应主动报告，但法律并未明确规定报告方式。
法律依据：
1.《刑法》第三十六条规定：有下列行为之一的，应当认定为举报人：
（一）报告违法犯罪行为，有功于侦破、起诉或者判决；
（二）在刑法规定的期限内，主动交代自己犯罪行为，有功于查清案件；
（三）在司法机关或者其他有关部门查处违法行为的过程中，协助查证取证，有功于查清案件。
2.《中华人民共和国企业破产法》第七十条规定：破产管理人、债权人委员会成员、债务人、债权人及其他利害关系人发现破产案件中有下列情形之一的，应当向管理人报告：
（一）破产案件中有违法行为的；
（二）破产案件中有牵涉到国家、集体和个人利益的重大问题的；
（三）破产案件中有可能影响其他破产案件、债权人权益或者社会公共利益的。
3.《中华人民共和国监察法》第二十七条规定：监察机关对举报人的举报，应当保护其个人隐私和人身安全，依法保障其合法权益。
总结：员工应当主动报告公司犯罪，可以通过向有关部门或者监察机关举报。法律保障员工的举报权益和个人隐私安全。
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