非法拘禁三小时不能立案。
国家机关工作人员涉嫌利用职权非法拘禁，具有下列情形之一的，应予立案：
1、非法拘禁持续时间超过二十四小时的；
2、三次以上非法拘禁他人，或者一次非法拘禁三人以上的；
3、非法拘禁他人，并实施捆绑、殴打、侮辱等行为的；
4、非法拘禁，致人伤残、死亡、精神失常的；
5、为索取债务非法扣押、拘禁他人，具有上述情形之一的；
6、司法工作人员对明知是无辜的人而非法拘禁的。
在对国家机关工作人员实施的非法拘禁行为是否构罪上，有一个度的规定，只有超过了这个度，才追究其刑事责任。国家机关工作人员因为其身份的特殊性，法律对其的要求比一般群众要严。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国刑法》
第二百三十八条  非法拘禁他人或者以其他方法非法剥夺他人人身自由的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利。具有殴打、侮辱情节的，从重处罚。
犯前款罪，致人重伤的，处三年以上十年以下有期徒刑;致人死亡的，处十年以上有期徒刑。使用暴力致人伤残、死亡的，依照本法第二百三十四条、第二百三十二条的规定定罪处罚。
为索取债务非法扣押、拘禁他人的，依照前两款的规定处罚。
国家机关工作人员利用职权犯前三款罪的，依照前三款的规定从重处罚。
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