工程保证金一般指建设工程质量保证金，指发包人与承包人在建设工程承包合同中约定，从应付的工程款中预留，用以保证承包人在缺陷责任期内对建设工程出现的缺陷进行维修的资金。缺陷责任期内，实行国库集中支付的政府投资项目，保证金的管理应按国库集中支付的有关规定执行。其他政府投资项目，保证金可以预留在财政部门或发包方。缺陷责任期内，由承包人原因造成的缺陷，承包人应负责维修，并承担鉴定及维修费用。如承包人不维修也不承担费用，发包人可按合同约定从保证金或银行保函中扣除，费用超出保证金额的，发包人可按合同约定向承包人进行索赔。承包人维修并承担相应费用后，不免除对工程的损失赔偿责任。缺陷责任期内，如发包方被撤销，保证金随交付使用资产一并移交使用单位管理，由使用单位代行发包人职责。如果施工单位和发包方就返还工程保证金产生了纠纷，那么应该属于建设工程施工合同纠纷。
一、工程的规划验收程序
验收会议上，工程施工、监理、设计、勘察察等各方的工程档案资料摆好备查，并设置验收人员登记表，做好登记手续。由建设单位组织工程竣工验收并主持验收会议（建设单位应做会前简短发言、工程竣工验收程序介绍及会议结束总结发言）。工程勘察、设计、施工、监理单位分别汇报工程合同履约情况和在工程建设各环节执行法律、法规和工程建设强制性标准情况。验收组审阅建设、勘察、设计、施工、监理单位的工程档案资料。验收组和专业组（由建设单位组织勘察、设计、施工、监理单位、监督站和其他有关专家组成）人员实地查验工程质量。专业组、验收组发表意见，分别对工程勘察、设计、施工、设备安装质量和各管理环节等方面作出全面评价；验收组形成工程竣工验收意见，填写《建设工程竣工验收报告》并签名（盖公章）。
二、建筑工程保证金是多少
保证金总预留比例不得高于工程价款结算总额的3％。保证金收取应该遵循几个原则，保证金的金额要大于合同预付款金额，以规避可能存在的风险；保证金的数目要与投标保证金持平或稍高，技术含量高、不能准时履约将会给采购人带来巨大损失的项目，要适当提高履约保证金数额；履约保证金数额的确定要与合同付款条件联系起来，初步设想两者之间应该成反比关系。
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