农村土地使用权变更登记也是到县级以上人民政府的土地行政主管部门办理的，就是原来的集体土地使用证在哪里办理的，变更登记也是归该部门所管辖的。
一、土地使用证归集体所有是什么意思
土地使用证是集体的意思是指集体土地使用证，它是证明土地使用者使用集体土地的法律凭证，受法律保护。农民集体所有的土地，由土地使用者向土地所在地的县级人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级人民政府进行登记，核发集体土地使用权证书，对使用权进行确权。
二、在房产证上加父母名字需要什么手续？
在房产证上加父母名字需要的手续：当事人房产证需要加名字的，只需携带国有土地使用证和房屋所有权证、身份证原件及复印件到县级以上地方人民政府房产管理部门申请房产变更登记即可，此时该房子就属于父母、子女共有的房产。
三、只有房产证，没有土地证可以过户吗
房地产转让的，应当向县级以上地方人民政府房产管理部门申请房产变更登记，并凭变更后的房屋所有权证书向同级人民政府土地管理部门申请土地使用权变更登记，经同级人民政府土地管理部门核实，由同级人民政府更换或者更改土地使用权证书。所以过户不仅要有房屋所有权证书还要有土地使用权证书。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国土地管理法实施条例》第六条，依法改变土地所有权、使用权的，必须向土地所在地的县级以上人民政府土地行政主管部门提出土地变更登记申请，由原土地登记机关依法进行土地所有权、使用权变更登记。
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