事业单位职工请病假是会被扣工资的，而且这部分的工资都是算作是绩效部分进行抵扣的，因为职工在享受基本的病假的期间没能给单位工作而让单位损失了部分的经济收益，此时扣除掉一点的工资也是为了弥补单位，而继续发工资也是法定基本的待遇。事业单位职工请病假是会扣一部分绩效工资的，具体由当地政策来决定，病假在2个月以内的，按月发放的基本工资和基础性绩效工资中的岗位津贴全额发放。
病假扣绩效是属于合法的，首先员工的绩效是根据员工工作情况而给予员工的奖励性待遇，在达标的情况下可以全额领取，员工请假没有工作，那么就没有绩效工资。
1.第二员工在病假期间的工资有法律规定，是不得低于当地最低工资水平的80%。所以没有扣员工的基本工资就可以了。
2.事业单位职工请病假是会被扣工资的，而且这部分的工资都是算作是绩效部分进行抵扣的，因为职工在享受基本的病假的期间没能给单位工作而让单位损失了部分的经济收益，此时扣除掉一点的工资也是为了弥补单位，而继续发工资也是法定基本的待遇。
3.事业单位病假工资依据什么给：职工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期间内由企业按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。
法律依据：
《职工带薪年休假条例》
第二条机关、团体、企业、事业单位、民办非企业单位、有雇工的个体工商户等单位的职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假（以下简称年休假）。单位应当保证职工享受年休假。职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。
第三条职工累计工作已满1年不满10年的，年休假5天；已满10年不满20年的，年休假10天；已满20年的，年休假15天。国家法定休假日、休息日不计入年休假的假期。
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