律师分析:
农村土地使用证补办流程：（一）向所在乡镇的土地管理所递交补办土地使用证的申请；（二）当地相关部门会派人前去核实自发证起房子是否保持现状及有没有扩建等情况；（三）相关部门核实确认后，需要登报说明遗失情况；（四）按当地土地管理所要求携带资料前去补办。
【法律依据】:
《中华人民共和国土地管理法》 第十二条 土地的所有权和使用权的登记，依照有关不动产登记的法律、行政法规执行。
依法登记的土地的所有权和使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。
