(一)办理集体土地使用证的法律依据根据《中华人民共和国土地管理法实施条例》第四条，农民集体所有的土地，由土地所有者向土地所在地的县级人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级人民政府登记造册，核发集体土地所有权证书，确认所有权。农民集体所有的土地依法用于非农业建设的，由土地使用者向土地所在地的县级人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级人民政府登记造册，核发集体土地使用权证书，确认建设用地使用权。设区的市人民政府可以对市辖区内农民集体所有的土地实行统一登记。可见，农民集体所有土地用于非农业建设的，才需要给使用权人发给土地使用证，发证机关为县级或者市级土地管理部门。

(二)办理集体土地使有证的办法根据《中华人民共和国土地管理法实施条例》第四条，农民集体所有的土地，由土地所有者向土地所在地的县级人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级人民政府登记造册，核发集体土地所有权证书，确认所有权。农民集体所有的土地依法用于非农业建设的，由土地使用者向土地所在地的县级人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级人民政府登记造册，核发集体土地使用权证书，确认建设用地使用权。设区的市人民政府可以对市辖区内农民集体所有的土地实行统一登记。

1、本人提出建房申请，建房申请书须经农民集体经济组织三分之二以上成员或三分之二以上成员代表签字同意，农村房助理员审核签字、村上盖章。

2、上报当地镇人民政府，由镇国土员实地踏勘，选址定点并填报农村住宅用地报审批表，村民委员会、国土员、镇人民政府再审批表上签署意见，附上建房示意图、新农村规划图、地形平面图;

3、报国土资源局规划科审批实否符合土地利用总体规划和新农村规划，如在城市规划区范围内，需经城市规划管理部门签署意见，并办理选址意见书、建设用地规划许可证;

4、国土资源局土地利用保护科审核建房位置、用地规模、土地用途是否符合规定，审查同意后发放农民宅基地批准通知书;

5、国土员根据农民宅基地批准通知书实地放线，待农房建成后，经本人申请，镇国土员对建房位置、用地规模、土地用途进行竣工验收;

6、凭农民宅基地批准通知书、农村居民建住宅验收合格单(有镇、村、组及国土员签署意见)到国土资源局申请土地登记，经地籍调查、权属审核合格后进行土地登记;

7、颁发集体土地使用证。管理集体土地所面临的真正的困难是，应该向集体经济成员进一步的普及国家集体土地管理法，很多农户在思想上根本就认识不到自己修建的房屋为什么不允许卖给其他人，从本质上来说，应该也是和国家管理集体土地并不是特别的严格是有一定关系的，对农村集体土地的管理还任重而道远。有在线律师，如果您有任何的疑惑，欢迎您随时咨询。

【本文关联的相关法律依据】

《土地管理法实施条例》第四条

农民集体所有的土地，由土地所有者向土地所在地的县级人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级人民政府登记造册，核发集体土地所有权证书，确认所有权。农民集体所有的土地依法用于非农业建设的，由土地使用者向土地所在地的县级人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级人民政府登记造册，核发集体土地使用权证书，确认建设用地使用权。设区的市人民政府可以对市辖区内农民集体所有的土地实行统一登记。