海南省跨县合作医疗报销流程如下：
1、本人或家属电话联系参合地经办机构申请办理跨省就医转诊；
2、选择跨省定点医疗机构就医，否则不予以报销；
3、患者携带身份证（或户口本）、合作医疗证、入院证明、转诊单（或转诊短信）办理入院手续；
4、患者出院时在新农合直接结报服务窗口结算，注意携带齐全的材料，支付个人自付费用即可。
报销比例：
1、门诊报销：普通门诊报销比例50%，每人每年报销封顶80元；门诊观察每日最多可报销30元，每年最多可报销1000元；门诊大病报销比例50%。
2、住院报销：乡镇级（一级）住院报销起付线200元，报销比例85%；县级（二级）定点医疗机构住院报销起付线500元，报销比例70%；市级（三级）定点医疗机构住院报销起付线700元，报销比例55%；省级（三级）定点医疗机构住院报销起付线1000元，报销比例50%；
3、大病报销国家确定的儿童白血病、儿童先天性病、终末期肾病、乳腺癌、宫颈癌、重性精神疾病、艾滋病机会性感染、耐多药肺结核、血友病、慢性粒细胞白血病、唇腭裂、肺癌、食道癌、胃癌、I型糖尿病、甲亢、急性心肌梗塞、脑梗死、结肠癌、直肠癌等20类重大疾病。医疗费用经新农合报销后，剩余合规费用8000元以下部分报销17%，超过8000元以上部分报销73%，个人最高年补偿限额20万元。
综上所述，异地就医人员须持有效社会保障卡在异地联网医疗机构办理登记，执行就医地医疗机构的就医流程和服务规范。【法律依据】：
《中华人民共和国社会保险法》第二条
国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。
第二十六条
职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。
第二十八条
符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。
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