题主是否想询问“跑步后肩背酸痛不舒服的原因”？乳酸堆积。跑步后肩背酸痛不舒服的原因是乳酸堆积。乳酸是由于跑步运动相对过度，超过了有氧运动的强度，而导致机体能量产生的无氧代谢而导致乳酸的形成，在体内会引起肩背局部肌肉的酸痛。