新鲜龙眼可以用保鲜膜封好后冷藏保存，也可以冷冻保存，冷冻保存能保存的时间更长，且果实能保持原来外观和固有风味，如果龙眼的数量较多，则可以选择将龙眼晒成龙眼干保存。
新鲜龙眼可以冷藏保存，也可以冷冻保存，都可以延长保存时间且保留风味，新鲜果皮较软，不可堆太多层，冷藏前最好将果皮风干，用保鲜袋装好保存。
在1小时内把龙眼果实的温度降到零下30摄氏度，并长期贮于零下18摄氏度的环境中，这样龙眼就能保持原来外观和固有风味，且营养成分损失少。
如果数量较多可以选择把新鲜的桂圆晒干后保存，晒干的桂圆保存的时间比较长，晒干的桂圆应放在箱子里，放在阴凉通风处保存，时常检查有无发霉。