芋圆和珍珠的区别有：发源地不同、原材料不同、颜色不同、形状不同。
1、发源地不同。芋圆是具有闽南风味的，福建和台湾地区的传统甜点。珍珠被叫做珍珠粉圆，又称粉圆，是台湾省的特色，粉圆甜羹是家喻户晓的可口点心，后来陆续经过食品专家将粉圆改良，流传至今。
2、原材料不同。芋圆的原材料通常为香芋，红薯，紫薯，木薯粉，珍珠的原材料是木薯淀粉、水，焦糖色素，羧甲基纤维素钠，食用香料。
3、颜色不同。芋圆是用香芋压成泥后混合红薯粉、紫薯粉或木薯淀粉蒸制而成的，因此颜色会更加丰富。而珍珠的成品一般为黑色。
4、形状不同。通常芋圆有圆柱和方块两种形状，珍珠为圆球状，一般情况下芋圆会比珍珠大一些。