小麦淀粉和玉米淀粉的区别是：原料不同、颜色不同、制作工序不同、用途不同。
1、原料不同。小麦淀粉的原材料是小麦，玉米淀粉的原材料是玉米。
2、颜色不同。小麦淀粉会比玉米淀粉更白，玉米淀粉的颜色会有一些淡黄色。
3、制作工序不同。制作小麦淀粉采用发酵法，小麦需要经过浸泡、研磨和发酵，让包围在淀粉颗粒周围的细胞溶解，使淀粉更容易分离。玉米淀粉需要用0.3%的亚硫酸浸渍玉米，然后破碎、过筛、沉淀、干燥、细磨等工序制作而成。
4、用途不同。小麦淀粉主要是食品的增稠剂或稳定剂等作用，个别也会用于做淀粉糖，在工业方面应用不多。玉米淀粉大多用于食品、工业、医药等方面的加工，在中餐和法餐中也会作为增稠剂，中餐中的勾芡指的就是玉米淀粉加水制成的汁。